تم‌های فلسفی و اخلاقی در پرتقال کوکی
۱. پرسش درباره‌ی اراده آزاد و مسئولیت اخلاقی
یکی از اصلی‌ترین تم‌های رمان، بررسی مفهوم اراده آزاد است. آیا بهتر است که انسان انتخاب کند و گاهی بد عمل کند، یا اینکه به زور مجبور شود به رفتارهای اخلاقی تن دهد؟ برجس این سوال را به شکل دراماتیکی مطرح می‌کند.

۲. نقد رفتارگرایی افراطی
روش درمان «تکنیک لودوویکو» نمایانگر رفتارگرایی افراطی است که به جای اصلاح ریشه‌ای، فقط رفتارها را کنترل می‌کند. این نقد به شیوه‌ای ملموس نشان می‌دهد که چنین روش‌هایی می‌توانند شخصیت و آزادی انسان را نابود کنند.

۳. خشونت و زیبایی در تضاد
در رمان، خشونت و زیبایی (موسیقی بتهوون) کنار هم قرار گرفته‌اند. این تضاد، پیچیدگی روانی شخصیت اصلی و همچنین تضادهای درون جامعه را به خوبی نشان می‌دهد.

۴. جامعه‌ی کنترل‌شده و فرد بی‌اراده
رمان تصویری از جامعه‌ای ارائه می‌دهد که در آن فرد هیچ اختیار و آزادی ندارد و همه چیز از پیش تعیین شده است. این تصویر هشدار برجس به ماست درباره‌ی خطرات دولت‌های اقتدارگرا.

۵. زبان به عنوان ابزار قدرت و مقاومت
زبان «ندست» نمادی از مقاومت فرهنگی است که نسل جوان در برابر جامعه مسلط ایجاد کرده است. این زبان غیرمعمول نشان می‌دهد که حتی در شرایط سخت، انسان‌ها راه‌هایی برای ابراز هویت و مخالفت پیدا می‌کنند.

۶. پایان باز و دعوت به تأمل
رمان پایان خوش یا بد قطعی ندارد و این پایان باز، خواننده را به فکر و تأمل درباره‌ی موضوعات مطرح شده و سرنوشت انسان در برابر جامعه و اختیار شخصی دعوت می‌کند.